Pages

Metode circRNA-seq Transkriptome Temukan RNA Melingkar

Jurnal KeSimpulan.com - Ada baiknya menemukan metode baru. Jika Anda menyelidiki fungsi biologis peran dalam siklus hidup virus maka Anda harus memeta RNA.

RNAse R adalah enzim Epicentre unik untuk menemukan penggunaan lebih besar dalam mempelajari RNA beruntai tunggal, termasuk RNA untai yang berisi tonjolan linier tunggal. Molekul-molekul ini memiliki fungsi biologis penting termasuk siklus hidup virus dan pematangan tRNA.

Namun, temuan RNA melingkar sejauh ini lebih banyak diperoleh secara kebetulan. Butuh metode untuk mempelajari.

Miri Danan, genetikawan Weizmann Institute of Science di Rehovot, Israel, dan rekan melapor sebuah metode baru ke Nucleic Acids Research.

Membaca RNA-seq diarahkan untuk pemetaan permutasi genom. Sebuah alur kerja memperkaya transkrip melingkar dan artefak dengan sampel RNA pre-treating menggunakan RNAse R.

RNA melingkar terisolasi digunakan dalam pengembangan metode sekuensing baru yaitu "circRNA-seq" yang menggunakan pengayaan dan memungkinkan kuantifikasi kelimpahan relatif atau prevalensi RNA dalam sel tanpa bias.

Tes diterapkan pada archaeon Sulfolobus solfataricus P2. RNA melingkar yang diidentifikasi termasuk bentuk-bentuk tidak hanya intron tRNA dan intermediet pemrosesan rRNA, tetapi juga banyak RNA dan RNA noncoding melingkar dengan fungsi yang tidak diketahui.

Banyak yang dilestarikan dalam S. acidocaldarius. Data menunjukkan RNA melingkar, RNA noncoding terutama melingkar, lebih sering terjadi pada archaea. Metode circRNA-seq memungkinkan studi baru RNA dalam organisme dan membantu menentukan fungsi relatif biologi sel.
Transcriptome-wide discovery of circular RNAs in Archaea

Miri Danan1, Schraga Schwartz1, Sarit Edelheit1 dan Rotem Sorek1
  1. Department of Molecular Genetics, Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel
Nucleic Acids Research, December 2, 2011

Akses : DOI:10.1093/nar/gkr1009
Gambar : Miri Danan et.al., DOI:10.1093/nar/gkr1009

Artikel Lainnya:

No comments:

Post a Comment