Pages

Proyek 1001 Genom Menjawab Evolusi Arabidopsis thaliana

Jurnal KeSimpulan.com - Proyek 1001 Genom katalogisasi genom lengkap selada Arabidopsis thaliana. Para iluwan berharap semakin memahami evolusi gulma.

Hewan dapat bermigrasi ke wilayah lain, sementara tanaman terpaku di lokasi mereka. Meskipun demikian, mereka menemukan cara untuk menjamin kelangsungan hidup.

Kasus tanaman Arabidopsis thaliana yang ditemukan di seluruh belahan Bumi utara. Tapi bagaimana mekanisme kecil mencolok ini dengan semua hal yang ekstrem berbeda?

Dalam rangka menemukan variasi sekuen seluruh genom maka diluncurkan 1001 Genomes Project pada tahun 2008 dengan 11 lembaga penelitian di seluruh dunia.

Dengan materi genetik sekitar 100 strain Arabidopsis thaliana dari daerah geografis yang berbeda, peneliti menemukan sejumlah besar variasi selain jutaan perbedaan-perbedaan kecil yang mengarah keragaman produk gen molekuler.

Ratusan gen hilang dalam beberapa strain atau salinan tambahan. Fleksibilitas membuat tanaman ini mudah beradaptasi. Gen dan varian gen memungkinkan individu berbeda dari satu spesies berkembang di bawah kondisi lingkungan yang sangat berbeda.

Arabidopsis thaliana cocok untuk menjawab berbagai pertanyaan. Mereka hidup dalam panas dan kekeringan di Afrika utara serta dingin di dataran tinggi Asia Tengah dan zona beriklim sedang di Eropa.

Dengan genom hampir 100 strain berbeda, para ilmuwan berharap mendapat pemahaman mendasar evolusi. Informasi harus membuka jalan era baru genetika alleles yang mendasari keragaman phenotypic di seluruh genom dan spesies.

Ribuan protein berbeda struktur dan fungsi dalam strain Arabidopsis berbeda. Selain itu, beberapa ribu kasus salinan tambahan gen, kehilangan gen, serta gen baru yang sebelumnya hanya ditemukan pada spesies tanaman lainnya.

"Kami menunjukkan betapa sangat mengesankan variabilitas genetik," kata Jun Cao, biolog dari Max Planck Institute for Developmental Biology di Tübingen, Jerman.

"Adaptasi melalui mutasi baru sangat jarang yang sering adalah rekombinasi varian. Dengan informasi lebih dari seratus genom, kita tidak hanya bicara tentang ratusan individu tapi juga meletakkan dasar prediksi potensi genetik individu tertentu," kata Karl Schmid, botanis dari University of Hohenheim.
Multiple reference genomes and transcriptomes for Arabidopsis thaliana

Xiangchao Gan1 et.al.
  1. Wellcome Trust Centre for Human Genetics, University of Oxford, Oxford OX3 7BN, UK
Nature, 28 August 2011

Akses : DOI:10.1038/nature10414

Reference-guided assembly of four diverse Arabidopsis thaliana genomes

Korbinian Schneeberger1,2 et.al.
  1. Department of Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, D-72076 Tübingen, Germany
  2. Department of Plant Developmental Biology, Max Planck Institute for Plant Breeding Research, D-50829 Cologne, Germany
PNAS June 21, 2011 vol. 108 no. 25 10249-10254

Akses : DOI:10.1073/pnas.1107739108
Jun Cao Max http://www.eb.tuebingen.mpg.de/
Karl Schmid http://evoplant.uni-hohenheim.de/doku.php?id=people:schmid

1001 Genomes Project http://www.1001genomes.org/

Artikel Lainnya: