Pages

Adenovirus Desain Komputer Untuk Vektor Terapi Gen

Jurnal KeSimpulan.com - Virus desain komputer dirancang yang menghasilkan manfaat ekspresi fenotipe. Adeno virus desain komputasi sebagai vektor terapi gen.

Terapi gen adalah bintang kedokteran dengan adeno-associated virus (AAV) sebagai vektor nonpathogenic parvoviruses karena kemampuan integrasi diri ke wilayah genom transcriptionally silent (tidak melalui RNA polimerase, membuat salinan RNA dari DNA).

Kelemahannya adalah merakit vektor AAV ke adenoviral virus yang digunakan secara ekstensif dalam penelitian genetik dan terapi mengandalkan replikasi protein yang membatasi metodologi amplifikasi virus.

Para peneliti di Stony Brook University menggunakan komputansi mikrobiologi untuk rereplikasi gen melalui synonymous codon pair recoding. Suatu teknik dengan mengubah dinamika atau situs mRNA.

Laporan ke Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) adalah hasil eksperimen yang menunjukkan nilai rekayasa synonymous codon pair recoding memiliki relevansi modifikasi ekspresi.

"Tim kami terdiri dari individu yang lama berkecimpung dalam biologi komputasi, virologi, dan terapi gen menggunakan virus. Modifikasi genom sebagai strategi terapi gen," kata Wadie Bahou, mikrobiolog dari Stony Brook University.

"Tim kami sebelumnya mengembangkan algoritma komputasi untuk mendesain ulang gen berdasarkan synonymous codon pair recoding," kata Bahou.

Langkah kunci adalah komputasi untuk mendesain ulang Rep 78/68 sehingga lebih baik ditoleransi oleh vektor adenoviral.

"Lompatan nyata berikutnya apakah algoritma dapat diterapkan untuk kasus interaksi virus. Desain ulang ini relatif mudah menggunakan algoritma komputasi," kata Bahou.

"Inovasi nyata di sini bahwa bias synonymous pair dapat untuk mengubah karakteristik mendasar fungsi biologis. Virus polio dan influenza telah menunjukkan relevansi untuk menghasilkan adenovirus terapi gen," kata Bahou.

"Sangat penting dicatat bahwa reprogram genom menggunakan synonymous codon pair recoding adalah konsep baru dan kami sepenuhnya mengantisipasi bahwa aplikasi dapat diperluas dari waktu ke waktu," kata Bahou.

"Secara teori kita mampu mengubah genom untuk kedua ekspresi yang dilemahkan dan ditingkatkan tergantung pada persyaratan situasional. Dalam hal ini sistem biologi lainnya terutama untuk memodifikasi sistem seluler di berbagai level," kata Bahou.
Computationally designed adeno-associated virus (AAV) Rep 78 is efficiently maintained within an adenovirus vector

Varsha Sitaraman1 et.al.
  1. Departments of Medicine Stony Brook University, Stony Brook, NY 11794

PNAS August 23, 2011 vol. 108 no. 34 14294-14299

Akses : DOI:10.1073/pnas.1102883108
Wadie Bahou http://indigo.gcrc.sunysb.edu/person.aspx?RecordID=Wadie%20Bahou

Gambar : Varsha Sitaraman et.al., PNAS DOI:10.1073/pnas.1102883108

Artikel Lainnya: