Pages

Project Achilles Memetakan Sistematis Seluruh Gen Pemicu Kanker

Jurnal KeSimpulan.com - Proyek Achilles untuk titik-titik kerentanan kanker ovarian. Kanker dapat dikalahkan tetapi kelemahan bisa sulit untuk dideteksi.

Upaya yang dikenal sebagai Project Achilles diluncurkan untuk mengembangkan cara sistematis menentukan titik-titik lemah ini. Sebagai upaya terbesar dan paling komprehensif hingga saat ini oleh para peneliti Broad Institute di Massachusetts Institute of Technology (MIT) dan Harvard serta Dana-Farber Cancer Institute.

Mereka memeriksa lebih dari 100 sel-sel tumor, termasuk 25 tumor kanker ovarium, untuk menggali gen kanker. Salah satu gen, PAX8, berubah dalam fraksi secara signifikan menjadi tumor ovarium hampir seperlima dalam survei studi. Hasilnya muncul di Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).

"Proyek ini, kami sedang mencari semua kanker. Kita mencari contoh di mana Anda menonaktifkan gen dan mempengaruhi kelangsungan hidup sel kanker," kata William Hahn, anggota asosiasi senior Broad Institute di MIT juga di Dana-Farber dan Harvard Medical School.

Para peneliti menekan ribuan gen menggunakan short hairpin RNAs (shRNAs) yang menawarkan cara untuk memprediksi efek obat atau terapi dengan target gen individu. Tim menggunakan lebih dari 54.000 shRNAs

Baru-baru ini, The Cancer Genome Atlas (TCGA) melaporkan 1.800 gen dalam genom kanker ovarium berulang kali menguat atau hadir dalam salinan tambahan. Tim Proyek Achilles membungkam lebih dari 10.000 gen yang dibutuhkan sel-sel kanker tumbuh dan bertahan hidup.

"Tidak hanya gen bermutasi atau berubah, tetapi kita juga sekaligus dapat menilai mana yang penting," kata Hahn.

Dengan memanfaatkan data TCGA, para peneliti secara cepat bisa menentukan mana dari 1.800 gen yang penting dalam pertumbuhan tumor ovarium.

"Metode yang kami kembangkan dalam konsorsium RNAi Platform membuat praktis dan relatif murah untuk shRNAs pada skala genomik dan wilayah pertama aplikasi kami dalam penelitian kanker," kata David Root, direktur RNAi Platform.

"Skala sampai dengan 100 baris sel yang dilaporkan adalah tantangan besar, tetapi kami juga melihat peluang besar. Dengan data baris sel lebih banyak kita memiliki kekuatan jauh lebih besar untuk mengidentifikasi target kanker penting," kata Root.

Proyek Penelitian terbaru Achilles juga membahas pertanyaan mendasar dalam biologi kanker. Selama beberapa dekade, kanker diklasifikasikan berdasarkan pada tempat jaringan, tetapi sepuluh tahun terakhir banyak ilmuwan menyarankan untuk mengklasifikasikan tumor berdasarkan mutasi genetik, terlepas dari mana kanker pertama dimulai.

"Kita tidak peduli dari mana kanker berasal, kita hanya akan peduli mutasi genetik yang mendorong mereka," kata Hahn.
Systematic investigation of genetic vulnerabilities across cancer cell lines reveals lineage-specific dependencies in ovarian cancer

Hiu Wing Cheung1 et,al.
  1. Department of Medical Oncology, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142
PNAS, July 11, 2011

Download dan Akses : DOI:10.1073/pnas.1109363108
William Hahn http://research4.dfci.harvard.edu/hahnlab//index.html
David Root http://www.broadinstitute.org/about/bios/bio-root.html

Broad Institute http://www.broadinstitute.org/

Artikel Lainnya:

No comments:

Post a Comment