Pages

Sekuens Genom Lengkap Patogen Gandum Mycosphaerella graminicola

Jurnal KeSimpulan.com - Tim konsorsium internasional selesai sekuensing genom Mycosphaerella graminicola. Upaya terbaru berperang melawan patogen tanaman gandum.

Konsorsium peneliti internasional dipimpin oleh U.S. Department of Agriculture (USDA) sepenyhnya telah menyelesaikan sekuens genome patogen gandum yang dikenal sebagai bercak septoria tritici yang dapat menyebabkan kerugian panen secara signifikan.

Menurut International Maize and Wheat Improvement Center di Meksiko, kerugian dapat mencapai 50 persen jika fungisida tidak digunakan untuk melindungi garis gandum rentan.

Penyakit ditemukan di setiap wilayah gandum yang tumbuh di dunia.

Sekuens genome yang dilaporkan ke PLoS Genetics ini dapat memberikan strategi untuk mengendalikan penyakit tersebut.

Patogen yang menyebabkan penyakit yaitu Mycosphaerella graminicola memiliki "masa tenang" tahap laten selama membutuhkan nutrisi dari tanaman hidup dan menghindar dari pertahanan alami tanaman host.

Para ilmuwan sebelumnya tidak memiliki pemahaman yang baik bagaimana organisme menginfeksi gandum.

"Memiliki sekuens lengkap genom M. graminicola dapat memberikan peneliti di seluruh dunia data yang diperlukan untuk mengurangi kerusakan patogen ini," kata Edward B. Knipling, administrator di Agricultural Research Service (ARS) di USDA.

M. graminicola adalah spora aseksual yang mempekerjakan "stealth" patogenisitas yaitu kemampuan menginfeksi tanpa ada perlawanan dari sistem pertahanan tanaman host.

"Banyak patogen menginfeksi tanaman host dengan menembus dinding sel tanaman. Tapi organisme ini tumbuh ke lubang alami tanaman, stomata , yang biasanya digunakan untuk pertukaran gas patogen kemudian tumbuh di antara dinding sel tanpa memicu respon pertahanan yang dirancang untuk menghentikan infeksi," kata Stephen Goodwin, patolog tanaman dari ARS Crop Production and Pest Control Research Unit di West Lafayette, Ind.

Patogen masuk ke dalam "masa tenang" dan kemudian beralih ke tahap patogen (penyebab penyakit).

"Kami tidak tahu peralihan apa yang terjadi dari fase laten ke fase patogen. Sekuens memungkinkan para ilmuwan untuk melihat ekspresi dari semua gen-gen yang terlibat dalam masa transisi," kata Goodwin.

Goodwin memimpin upaya sekuensing bersama dengan Igor V. Grigoriev dari U.S. Department of Energy's Joint Genome Institute di Walnut Creek, Calif., dan Gert H. J. Kema dari Plant Research International B.V., Wageningen, Belanda. Team internasional dari Australia, Brazil, Perancis, Jerman, Iran, Mexico, Swiss, dan Inggris.
Finished Genome of the Fungal Wheat Pathogen Mycosphaerella graminicola Reveals Dispensome Structure, Chromosome Plasticity, and Stealth Pathogenes

Stephen B. Goodwin1 et.al.
  1. USDA–Agricultural Research Service, Purdue University, West Lafayette, Indiana, United States of America
PLoS Genetics, 7(6): e1002070, June 9, 2011

Download dan Akses : DOI:10.1371/journal.pgen.1002070
Edward B. Knipling http://www.ars.usda.gov/pandp/people/people.htm?personid=9490
Stephen Goodwin http://www.ars.usda.gov/pandp/people/people.htm?personid=2061

USDA's Agricultural Research Service (ARS) http://www.ars.usda.gov
U.S. Department of Agriculture (USDA) http://www.usda.gov
International Maize and Wheat Improvement Center http://www.cimmyt.org/
Plant Research International http://www.pri.wur.nl/uk

Gambar : Plant Research International http://www.pri.wur.nl/uk

Artikel Lainnya:

No comments:

Post a Comment