Pages

Keragaman Rendah Sekuens Genom Lengkap Tasmanian Devil

Jurnal KeSimpulan.com - Genom Tasmanian Devil Sarcophilus harrisii menawarkan harapan. Tim internasional tuntaskan dua set lengkap blueprint sekuens genetik setan Tasmania.

Dua set baru blueprint genetik tidak menawarkan petunjuk untuk menghentikan populasi dari epidemi kanker tetapi mengungkapkan secara stabil keragaman genetik rendah berjuang melawan epidemi.

Data mengandung berita baik sekaligus buruk bagi spesies.

Kabar buruknya yaitu keragaman genetik fauna berkantung ini terendah dari semua spesies yang selama ini dikenal. Kabar baiknya bahwa keragaman rendah iblis memiliki sejarah panjang dan mungkin tidak menjadi alasan keprihatinan.

"Keragaman genetik rendah tidak berarti spesies ini dikutuk. Jika Anda mempertahankan seluruh keragaman, spesies ini masih layak," kata Stephan Schuster, genomikawan Pennsylvania State University.

Sebuah tim peneliti internasional dipimpin oleh Schuster mengekstrak cetak biru genetik setan Tasmania bernama Cedric dan Spirit yang berasal dari ujung berlawanan di Tasmania dan melapor ke Proceedings of the National Academy of Sciences.

Kedua devil juga kontras dalam respon terhadap kanker menular yang telah menghancur populasi setan liar. Studi dilakukan sebagai bagian dari upaya untuk lebih memahami penyakit mematikan dan menyelamatkan spesies.

Cedric salah satu dari beberapa setan yang memiliki sistem kekebalan tubuh dapat melawan kanker menular yang telah menyapu lebih dari setengah populasi. Cedric selamat dari dua upaya infeksi penyakit tumor wajah, tetapi akhirnya menyerah pada strain ketiga. Sedangkan Spirit sudah terinfeksi dengan lima tumor dan sudah mendekati ajal ketika ditangkap.

Para peneliti berharap katalogisasi dan perbandingan genom dua hewan dapat menunjukkan mengapa Cedric kebal terhadap kanker fatal saat Roh dan banyak devil lain tewas.

Analisis awal dua genom tidak memberikan jawaban yang jelas, namun para peneliti percaya studi lebih lanjut dapat mengungkapkan rahasia untuk mengalahkan penyakit mematikan yang mungkin terkubur dalam blueprint tersebut. Para ilmuwan menduga setan yang paling banyak memiliki varian gen tertentu membuat mereka lebih rentan terhadap penyakit tumor.

"Temuan benar-benar menarik. Kami sangat gembira, lompatan dan memulai mengolah genom ini," kata Katherine Belov, genetikawan dari University of Sydney yang tidak terlibat dalam penelitian ini.

Studi mengungkap rincian lebih lanjut tentang keragaman genetik populasi Tasmania devil saat ini. Sementara para peneliti sudah lama mengetahui bahwa setan memiliki tingkat rendah keragaman genetik, studi baru menunjukkan keragaman Iblis analog sekitar 20 persen keragaman pada manusia.

Sebuah analisis DNA spesimen museum dari tahun 1874 (setidaknya 100 tahun sebelum kanker menular pertama kali muncul) menemukan setan memiliki tingkat keanekaragaman genetik dalam waktu lama. Tumor belum mengurangi jumlah keragaman dalam populasi liar, para peneliti menemukan setelah pengujian 168 setan liar.

"Spesies tampak melakukannya dengan cukup baik bahkan dengan keragaman rendah," kata Anne Yoder, bioevolusionaris dari Lemur Center di Duke University.

Tentu saja sebelum kanker menular memukul, keragaman rendah mungkin mempengaruhi seberapa baik setan berjuang melawan penyakit. Karena begitu mirip genetik satu sama lain maka sistem kekebalan tubuh mengalami kesulitan mengenali sel tumor yang diwariskan.

Beberapa ilmuwan telah mengusulkan bukan kanker yang sedang menjalar langsung dari satu hewan ke hewan yang lain, tetapi virus ditularkan selama gigitan menjadi penyebab kanker.

"Studi baru mengkonfirmasi bahwa ini adalah klon kanker," kata Belov.

Schuster mengatakan meskipun keragaman genetik rendah yang membuat setan rentan terhadap kanker, bukanlah tidak dapat diatasi. Penggunaan tes genetik harus digunakan untuk menyesuaikan pasangan kawin yang relatif beragam, bukan berharap secara acak memilih hewan yang dapat mempertahankan keragaman rapuh.

"Ini mungkin salah satu kasus di mana intervensi manusia melakukan semua hal yang benar, dapat mencegah spesies dari kepunahan," kata Schuster.
Genetic diversity and population structure of the endangered marsupial Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil)

Webb Miller1 et.al.
  1. Pennsylvania State University, Center for Comparative Genomics and Bioinformatics, University Park, PA 16802
PNAS, June 27, 2011

Download dan Akses : DOI:10.1073/pnas.1102838108
Stephan Schuster http://www.cidd.psu.edu/people/scs19
Katherine Belov http://sydney.edu.au/vetscience/about/staff/kbelov.shtml
Anne Yoder http://lemur.duke.edu/people/

Artikel Lainnya:

No comments:

Post a Comment