Pages

Teknik Pelabelan CLASIFISH Membuat Ciri Komunitas Mikroba Bercahaya

Jurnal KeSimpulan.com - Pelabelan Kombinatorial Membuat Komunitas Mikroba Bercahaya. Peneliti menciptakan teknik kombinasi sehingga ras mikroorganisme terlihat mencolok.

Mikroba sering berinteraksi secara kompleks dalam masyarakat multi species. Namun menganalisis organisasi masyarakat ini terbukti sangat menantang karena teknik saat ini membatasi jumlah taksa yang dapat diberi label dan dicitrakan dalam eksperimen tunggal. Sekarang Alex Valm, biooseanografer dari Marine Biological Laboratory memiliki kombinasi strategi gabungan bagi ormas ini.

Valm menggabungkan pelabelan biologis dan analisis pencitraan yang dapat memperluas jumlah tanda tangan mikroba sehingga secara bersamaan dapat divisualisasikan. Peneliti menggunakan fluorescence in situ hybridization (FISH) untuk label jenis mikroorganisme individu dengan dua dari delapan satelit FISH yang biasa dilakukan sehingga 28 pasang tag unik dialihkan.

Menggunakan laser scanning confocal microscopy untuk mencitrakan tag ini dimana sebuah program komputer membedakan dan menyusun peta distribusi mikroba dalam sebuah masyarakat. Eksperimen dilakukan terhadap 28 populasi murni Escherichia coli. Valm menjuluki teknik akurat ini dengan Combinatorial Labeling and Spectral Imaging FISH (CLASI-FISH).

Para peneliti juga menerapkan CLASI-FISH pada plak gigi manusia, kemudian dicitrakan dalam 15 taksa secara bersamaan dan menetapkan koloni awal seperti Streptococcus, Prevotella, Actinomyces, dan Veillonella sebagai masyarakat yang mendominasi plak gigi manusia serta melapor ke Proceedings of the National Academy of the Sciences (PNAS).

Valm mengatakan perangkat tambahan semakin memungkinkan potensi CLASIFISH secara penuh dapat menemukan karakteristik kompleks mikroba besar. Para peneliti menyarankan teknik mereka bisa diadaptasi untuk disiplin lain seperti menganalisa bagaimana struktur biologis kompleks dalam sebuah organisasi.
Systems-level analysis of microbial community organization through combinatorial labeling and spectral imaging

Penulis :

Alex M. Valm1,2
Jessica L. Mark Welch1
Christopher W. Rieken1
Yuko Hasegawa1,2
Mitchell L. Sogin1,2
Rudolf Oldenbourg1.2
Floyd E. Dewhirst3,4
Gary G. Borisy1

Afiliasi :
  1. Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA 02543
  2. Brown University, Providence, RI 02912
  3. The Forsyth Institute, Cambridge, MA 02142
  4. Department of Oral Medicine, Infection & Immunity, Harvard School of Dental Medicine, Boston, MA 02115
Penerbit : PNAS February 16, 2011.

Download dan Akses : DOI:10.1073/pnas.1101134108
Credit : Alex M. Valm et.al., PNAS, DOI:10.1073/pnas.1101134108

Artikel Lainnya:

No comments:

Post a Comment