Pages

Proyek Digital Eurexpress A Transcriptome Atlas Database for Mouse Embryo

Jurnal KeSimpulan.com - Sebuah atlas anatomi resolusi tinggi dari transkriptome di embrio tikus. Tim ilmuwan internasional memetakan perkembangan ekspresi gen embrio.

Sementara setiap sel dari suatu organisme mengandung gen yang sama, hanya proporsi yang disajikan dalam jaringan apapun pada tahap tertentu dalam perkembangan. Mengetahui tingkat transkripsi gen menjadi hal yang berharga dan sebuah tim peneliti Eropa telah memetakan atlas ekspresi gen untuk perkembangan embrio tikus.

Temuan dapat menjadi sumber yang kuat untuk menentukan secara bersama ekspresi gen dan untuk mengidentifikasi korelasi fungsional antara gen yang relevan dengan perkembangan dan penyakit. Para ilmuwan mempublikasikan dalam sebuah makalah di PLoS Biology.

Temuan juga dapat diakses secara komprehensif, interaktif dan bebas sebagai proyek atlas digital ekspresi gen "Eurexpress : A Transcriptome Atlas Database for Mouse Embryo" (www.eurexpress.org) yang mencakup data ekspresi lebih dari 15.000 gen pada ratusan struktur anatomi dan identifikasi spesifik serta jaringan-jaringan gen yang tumpang tindih.

Sebagai contoh data mengungkap informasi baru untuk struktur telencephalon yaitu sebuah organisasi baru hipotalamus dan wawasan tentang jalur sinyal yang terlibat dalam diferensiasi epithelial ginjal selama perkembangan ginjal. Proyek ini melibatkan peneliti dari 12 institusi di Eropa dengan berbagai bidang studi berbeda (Italia, Spanyol, Inggris, Jerman, Perancis dan Swiss).

"Pekerjaan ini hanya dimungkinkan atas kerja sama erat dari semua ilmuwan yang terlibat dan deskirpsi yang baik untuk keberhasilan dalam upaya yang terkoordinasi dan kolaboratif. The gene expression atlas akan menjadi manual penting untuk menemukan fungsi gen dan mekanisme penyakit," kata Profesor Andrea Ballabio, koordinator studi dari Telethon Institute of Genetics and Medicine di Naples, Italia.

"Ukuran tugas yang diperlukan tim spesialis yang dikombinasi dari keahlian yang berbeda diperlukan untuk mencapai output yang lebih besar daripada jumlah perbagian-bagian, data tersedia secara gratis dan pencitraan yang mengesankan akan sangat membantu untuk semua peneliti yang bekerja pada fungsi genome dan molekul yang menyebabkan begitu banyak gangguan genetik," kata Profesor Stylianos Antonarakis, salah satu kolaborator studi dari University of Geneva di Swiss.

Pendanaan studi ini didukung oleh EC VI Framework Programme contract number LSHG-CT-2004-512003. Peneliti juga mengakui dukungan dari the Italian Telethon Foundation (AB, SB, and GD-R); the Swiss National Science Foundation (AR and SEA); the Max Planck Society (GE, M-LY, HL); MRC (RB, DD); Association pour la Recherche sur le Cancer (PD); and Ingenio 2010 MEC-CONSOLIDER CSD2007-00023, DIGESIC-MEC BFU2008-00588, CIBERSAM /ISCIII (SM).

Para penyandang dana tidak memiliki peran dalam desain penelitian, pengumpulan data dan analisis, keputusan untuk mempublikasikan, atau penyusunan laporan. Para peneliti menyatakan tidak ada kepentingan apapun dari para penyandang dana.

Silahkan akses laporan studi dan download ke PLoS Biology di alamat :

http://www.plosbiology.org/article/info:doi/10.1371/journal.pbio.1000582

Situs resmi Eurexpress di http://www.eurexpress.org

Artikel Lainnya:

No comments:

Post a Comment